CAFIA在捷克13个州分别设有分局,负责各自辖区的农产品和食品安全,并建立有完善的电子检验和办公系统,每个工作人员都可以移动办公,电脑和手机随时都可以搜集、保存和发送有关信息。CAFIA的财政支出由国家统一负责,一般不收检验费;但被检食品如果存在质量和卫生问题,进行复检时需要相关企业或人员支付费用。
CAFIA于2005年获得了ISO9001—2000认证证书,现有雇员473人,专业检验人员219人,62%以上的工作人员具有大学学历。CAFIA需要负责对9500个食品企业生产者实施监督检查。2008年,CAFIA完成了对32459个在册食品企业的73837项控制指标检查,检出不合格样品5878个,约有200万欧元货值的食品由于不符合欧盟的标准被查处。
CAFIA设立了两个实验室,一个在首都布拉格,另一个在布尔诺,两个实验室均通过了ISO17025认证,除了开展常规理化分析以外,还能开展转基因分析。其中,布拉格实验室还可以进行食用添加剂、有毒物质和放射性物质的分析。