通关单是法定的出入境单证，是连接检验检疫和海关工作的重要纽带。以往进出口企业或其代理人在办理进出口法检货物通关前，必须首先向检验检疫部门报检，取得出/入境货物通关单，并据此向海关部门办理进一步的通关手续。长期以来，通关单的申请、缮制、传递、核对均以纸质方式进行，对于口岸监管部门和相关企业而言，都存在着不方便、不安全和耗时耗力等问题。

　　实施无纸化通关后，对所有法检商品，海关凭检验检疫部门发送的出/入境货物通关单电子数据就可为企业办理进出口通关手续。除应急等特殊情况外，检验检疫部门不再签发、海关也不再收取纸质通关单（入境可利用废物原料、严重违法违规企业或被海关和检验检疫机构列为黑名单的企业货物除外）。

　　据统计，广东汕头检验检疫局辖区过去一年共签发通关单12万份，若领取和送达一份通关单的时间和交通成本按200元计算，该措施一年内将可为企业节约成本2400万元，每批货物的通关时间至少可缩短两个小时。