欧盟农药残留限量值（MRLs）的制定是在理事会指令91/414/EEC，植物保护产品在市场上的销售基础之上建立起来的。
最大残留限量值（MRLs）的申请，必须依据特定农业使用结合农药毒理学来递交数据。MRL值是通过对日容许摄入量(ADI)和急性毒性参考剂量(ARfD) 导出的毒理学信息进行“监督试验”后进行确定。
通过计算欧盟不同消费群体长期和短期对被农药处理过的所有食品中残留物的摄入并且比较 ADI和 ARfD，来确定是食品中可以接受的农药最大残留限量（MRL）。
如果所确定的MRL值是不安全的，将设定最低的分析检测限值（LOD）最为MRL值。分析检测限值（LOD）也可应用于没使用农药或没留下农药残留痕迹的农作物。欧盟法规规定分析检测限值（LOD）的默认值是0.01mg/kg。
欧盟食品安全委员会（EFSA）负责对所设定的每个新的MRL值进行评估。
此外，为增加透明性和便于查询，欧盟建立了数据库，可以在欧盟官方网搜索适用于每个作物和农药的最高残留限量。
